Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
BHLHE40O14503 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BHLHE40O14503 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms