Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VWA5AO00534 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VWA5AO00534 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms