Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GFRA2O00451 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GFRA2O00451 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms