Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TULP2O00295 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TULP2O00295 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TULP2O00295 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TULP2O00295 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TULP2O00295 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TULP2O00295 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TULP2O00295 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TULP2O00295 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP2O00295 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TULP2O00295 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms