Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3B1O00203 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP3B1O00203 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms