Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
I3L4J1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
I3L4J1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
I3L4J1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
I3L4J1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
I3L4J1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
I3L4J1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
I3L4J1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
I3L4J1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
I3L4J1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
I3L4J1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
I3L4J1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
I3L4J1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms