Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H7C0C1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H7C0C1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0C1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0C1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0C1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H7C0C1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H7C0C1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H7C0C1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H7C0C1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H7C0C1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H7C0C1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms