Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NPIPB9F8W1W9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NPIPB9F8W1W9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms