Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMO7DNF2Z398 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMO7DNF2Z398 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms