Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E9PBE3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E9PBE3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E9PBE3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E9PBE3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E9PBE3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PBE3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PBE3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PBE3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PBE3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
E9PBE3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
E9PBE3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
E9PBE3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms