Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C9orf172C9J069 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C9orf172C9J069 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1148.2 ms