Protein–RNA interactions for Protein: B5ME19

EIF3CL, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CLB5ME19 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EIF3CLB5ME19 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3CLB5ME19 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms