Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
B4E1Z4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
B4E1Z4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
B4E1Z4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
B4E1Z4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
B4E1Z4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
B4E1Z4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
B4E1Z4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms