Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
B4DXG7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
B4DXG7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
B4DXG7 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
B4DXG7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
B4DXG7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DXG7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DXG7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DXG7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DXG7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
B4DXG7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
B4DXG7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
B4DXG7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms