Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRRM5B3KS81 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRRM5B3KS81 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms