Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SMIM1B2RUZ4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SMIM1B2RUZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms