Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NOTOA8MTQ0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms