Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEURL1BA8MQ27 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NEURL1BA8MQ27 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms