Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CYSRT1A8MQ03 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CYSRT1A8MQ03 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms