Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZNF316A6NFI3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZNF316A6NFI3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms