Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI5

LINC00862, Putative transmembrane protein encoded by LINC00862, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00862A6NCI5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00862A6NCI5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LINC00862A6NCI5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms