Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRAMEF22A3QJZ6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRAMEF22A3QJZ6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms