Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC162PA2VCL2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CCDC162PA2VCL2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms