Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
HMX2A2RU54 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HMX2A2RU54 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms