Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
POTEB3A0JP26 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
POTEB3A0JP26 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms