Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NTM-203ENST00000374791 3040 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARHGAP25-207ENST00000467265 2247 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PEX5-202ENST00000266564 3170 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PAPD4-207ENST00000504233 2997 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NBPF13P-201ENST00000444082 1783 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALDH3A2-202ENST00000339618 3828 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CYFIP1-207ENST00000617556 5674 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF619-204ENST00000447116 4153 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DDX27-207ENST00000622530 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PSTPIP2-201ENST00000409746 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 GPR179-203ENST00000616987 7980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UVRAG-207ENST00000531818 3152 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UMPS-201ENST00000232607 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AP001198.1-201ENST00000586278 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CDH2-201ENST00000269141 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MIR646HG-207ENST00000432910 2043 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 LILRB2-201ENST00000314446 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SPDYE16-202ENST00000632547 3434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL023802.1-201ENST00000447372 3775 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MAP3K14-201ENST00000344686 4460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TMEM170A-201ENST00000357613 4959 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 FP700111.1-201ENST00000441760 2502 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 IFT74-201ENST00000380062 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF100-206ENST00000608416 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARHGEF11-201ENST00000361409 5788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 VWDE-206ENST00000614403 4701 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC002101.1-201ENST00000564021 1990 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DNAJB5-204ENST00000454002 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PSMD1-201ENST00000308696 3326 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MRPL24-201ENST00000361531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL121656.1-201ENST00000440786 482 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 AL139823.1-201ENST00000641871 1225 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 DNAJC17-201ENST00000220496 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 SOGA1-202ENST00000279034 3703 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
LSAMPQ13449 EFCAB12-201ENST00000326085 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC009264.1-205ENST00000439694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 ZNF133-214ENST00000628216 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MEGF8-202ENST00000334370 10966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 WDR62-201ENST00000270301 4632 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TRMT10A-201ENST00000273962 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 MAP6-204ENST00000526740 1755 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 CES5A-204ENST00000520435 1948 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RCHY1-201ENST00000324439 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 AC022148.1-201ENST00000316807 3267 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 RRM2-212ENST00000615152 3434 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
LSAMPQ13449 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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