Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ZNF621-201ENST00000310898 2404 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 MCFD2-212ENST00000444761 4169 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 RAB10-201ENST00000264710 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 PSMA1-201ENST00000396394 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 TUBAL3-202ENST00000479328 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL021408.2-201ENST00000624196 1544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 BRF2-201ENST00000220659 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ANXA13-201ENST00000262219 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ARSF-201ENST00000359361 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 CKS2-201ENST00000314355 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 CD27-AS1-201ENST00000399492 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 SKA1-203ENST00000417656 1095 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL355493.1-201ENST00000422707 808 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 SNRPCP15-201ENST00000424055 192 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 POU5F1-202ENST00000441888 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC104445.1-201ENST00000460597 749 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC087071.1-201ENST00000469264 427 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 VEGFA-225ENST00000523950 954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC002519.2-201ENST00000563575 539 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 HP-215ENST00000569639 568 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC020897.1-201ENST00000587702 561 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 CYP4F10P-201ENST00000589560 752 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AL157392.3-201ENST00000601075 833 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC021683.4-201ENST00000623348 1099 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 AC084855.2-201ENST00000559400 2393 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ZNF221-202ENST00000587682 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 POLL-203ENST00000370162 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AS3MT-201ENST00000369880 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 HIPK1-AS1-204ENST00000450706 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 ELN-201ENST00000252034 3781 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 KCNMA1-227ENST00000638203 3840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 KCNMA1-232ENST00000638306 3811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 KCNMA1-233ENST00000638351 3849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 AP001198.1-201ENST00000586278 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
PTPRJQ12913 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 ANKRD13A-201ENST00000261739 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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PTPRJQ12913 LILRB2-204ENST00000391749 2286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 FAM96A-201ENST00000300030 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TCEAL9-201ENST00000372656 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TCEAL9-202ENST00000372661 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SNAPC5-203ENST00000395589 749 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 GPR35-205ENST00000438013 3821 ntAPPRIS P3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 PSMB8-AS1-206ENST00000458296 958 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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PTPRJQ12913 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 TRIAP1-202ENST00000546954 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AL160313.2-201ENST00000555875 493 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SNAPC5-205ENST00000563480 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 AC108102.1-201ENST00000606528 548 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 NF2-204ENST00000361166 1837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PTPRJQ12913 MEF2C-207ENST00000503554 1345 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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