Protein–RNA interactions for Protein: V9GY48

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY48 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GY48 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GY48 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GY48 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GY48 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GY48 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GY48 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GY48 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GY48 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
V9GY48 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
V9GY48 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
V9GY48 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
V9GY48 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms