Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms