Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LINC00312Q9Y6C7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00312Q9Y6C7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms