Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPQQ9Y646 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPQQ9Y646 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms