Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRG3Q9Y2Y8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG3Q9Y2Y8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms