Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X8

UBE2D4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D4, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D4Q9Y2X8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBE2D4Q9Y2X8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBE2D4Q9Y2X8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms