Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
USP20Q9Y2K6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP20Q9Y2K6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms