Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ERVW-1Q9UQF0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms