Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGTPBP1Q9UPW5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGTPBP1Q9UPW5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms