Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TTF2Q9UNY4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TTF2Q9UNY4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TTF2Q9UNY4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms