Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYNRGQ9UMZ2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SYNRGQ9UMZ2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms