Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB4

CDH9, Cadherin-9, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH9Q9ULB4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CDH9Q9ULB4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CDH9Q9ULB4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CDH9Q9ULB4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms