Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL51

HCN2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN2Q9UL51 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
HCN2Q9UL51 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
HCN2Q9UL51 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HCN2Q9UL51 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms