Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SARDHQ9UL12 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SARDHQ9UL12 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms