Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AMFRQ9UKV5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AMFRQ9UKV5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AMFRQ9UKV5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms