Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PARP4Q9UKK3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PARP4Q9UKK3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PARP4Q9UKK3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms