Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG4

SLC13A4, Solute carrier family 13 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A4Q9UKG4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SLC13A4Q9UKG4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC13A4Q9UKG4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms