Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RCAN3Q9UKA8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RCAN3Q9UKA8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCAN3Q9UKA8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms