Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT2

TSKS, Testis-specific serine kinase substrate, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKSQ9UJT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TSKSQ9UJT2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TSKSQ9UJT2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms