Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
OPN4Q9UHM6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
OPN4Q9UHM6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms