Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
EPHA6Q9UF33 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
EPHA6Q9UF33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms