Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CFDP1Q9UEE9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CFDP1Q9UEE9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
CFDP1Q9UEE9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms