Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
COPS7AQ9UBW8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
COPS7AQ9UBW8 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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